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研究員兼所長
明清思想文化史
特聘研究員
中國近代思想史、文化史
中國宗教社會史，台灣宗教社會史，中國道教史
研究員
台灣史、近代史、經濟與政治經濟思想史、亞太區域史
清史
近代中日關係史研究、近代日本政治思想史研究、近代日本外交史研究
明清社會經濟史、明清文化史、中國城市史
研究員兼副所長
晚清史
中國近代政治社會史
蘇聯史、黨國體制比較、中蘇文化關係
傳統醫療與公共衛生史（近代中國與台灣）、科技史與身體史、科技與社會研究
婦女史、城市文化史、企業史
副研究員
經濟發展史、中國近代經濟史、台灣經濟史
中國近現代經濟史，經濟思想史
中法關係史、中越關係史
中國近代社會經濟史、抗戰史
中國醫療史、東亞科學史
近代中外貿易史、近代中國城市文化史、近代醫療史
近代中國社會文化史、法制史、教育史
視覺文化史、晚清中日交流、清宮研究、中歐圖像交流
近代中國思想文化史、學術史
近代中國族群政治史；中共史
助研究員
科技史、環境史、十九世紀通商口岸、GIS與歷史研究
中國「現代政治」史、國民政府史、國共政治比較研究、政治史方法論、青年政治
近代中國思想文化史、概念史與詞彙史、當代歐美史學理論
近代中國軍事史、民國政治史、蔣中正研究
中國語言學及語言知識史；中國學術及教育史；清帝國與世界史