專書、論文集

• 林滿紅，2021年，《經貿臺灣與大歷史》，共299頁，臺北：蘭臺出版社。
• 林滿紅，2017年，《獵巫、叫魂與臺灣定位：兼論釣魚臺與南海歸屬問題》，共351頁，臺北市：黎明文化事業股份有限公司。
• 林滿紅，2011年，《银綫》，共318頁，南京：江蘇人民出版社。
• 林滿紅，2011年，《銀線》，共374頁，臺北：國立臺灣大學出版中心。
• 林滿紅，2008年，《獵巫、叫魂與認同危機：臺灣定位新論》，共202頁，臺北：黎明文化出版公司。
• 林滿紅，2002年，《晚近史學與兩岸思維》，共367頁，臺北：麥田出版社。
• 林滿紅，1997年，《台湾海峡両岸経済交流史》，共149頁，東京：日本交流協會。
• 林滿紅，1997年，《茶、糖、樟腦業與台灣之社會經濟變遷，1860-1895》，共230頁，臺北：聯經出版公司。
• 林滿紅，1994年，《四百年來的兩岸分合：一個經貿史的回顧》，共158頁，臺北：自立晚報。
• 林滿紅，1978年，《茶、糖、樟腦業與晚清臺灣》，臺灣銀行研究叢刊第115種，共98頁，臺北：臺灣銀行經濟研究室。

主編之專書(論文集)

• 林滿紅主編、趙祐志副主編，2019年，《普通型高級中等學校歷史 第一冊》，共203頁，新北市：泰宇出版股份有限公司。
• William C. Kirby, Man-houng Lin, James Shih, David A. Pietz, eds., 2001, State and Economy in Republican China: A Handbook for Scholars, 528 pages, Harvard University Asia Center: Harvard University Press.
• 林滿紅主編，1998年，《「一八九五系列」》（共10本），共2666頁，臺北：稻鄉出版社。
• 林滿紅、黃富三、翁佳音主編，1997年，《清末臺灣海關歷年資料 I、II》，共1140頁，臺北：中央研究院臺灣史研究所籌備處。
• 林滿紅、黃富三、翁佳音主編，1997年，《清末臺灣海關歷年資料 I、II》，共1140頁，臺北：中央研究院臺灣史研究所籌備處。
• 林滿紅主編，1995年，《臺灣所藏中華民國經濟檔案》，共564頁，臺北：中央研究院近代史所（中央研究院近代史所與美國哈佛大學東亞研究中心合作計畫）。

期刊論文

• Man-houng Lin, Yi-Chen Huang, Dec. 2024, “Yizhou夷洲” and “Liuqiu流求” in Historical Chinese Texts: International Relations on the Northeast Asian Seas (3rd-17th Centuries)”, Asia Paper, pp. 1-80, Stockholm: Institute for Security and Development Policy. (https://www.isdp.eu/wp-content/uploads/2024/12/Asia-Paper-Lin-final-1.pdf)
• Man-houng Lin, Yi-Chen Huang, Aug. 2023, “Has Taiwan Been China’s Since Ancient Times? ‘Yizhou’and ‘Liuqiu’ in Historical Records”, editor(s): Bo-jiun Jing and Torbjörn Lodén, Assessing the Development of Taiwanese Identity, Special Paper, pp. 12-23, Stockholm: Institute for Security and Development Policy. (https://isdp.eu/wp-content/uploads/2023/08/ISDP-Special-Paper-Taiwan-Identity-3.pdf)
• 林滿紅、黃亦晨，2023年12月，〈漢籍文獻中的「夷洲」與「流求」——3至17世紀東北亞海域的國際關係〉，《中華國際法與超國界法評論》，第19卷第2期，臺北：中華民國國際法學會，頁49-120。
• 林滿紅，2020年6月，〈貨幣、圖像與國家：中華民國的臺灣化，1945-2002〉，《思想》，第40期，臺北：聯經出版社，頁43-62。
• 林滿紅，2020年5月，〈次第に現れる太平洋：自らの著作における海洋イメージの変遷（1976-2018）〉（TheThe Gradually Emerging Pacific: my study from socio-economic history to Asia-Pacific study），《社會經濟史學》，第86卷第1號，東京：社會經濟史學會，頁1-24. (https://doi.org/10.20624/sehs.86.1_5)
• Man-houng Lin, Feb. 2020, “Taiwan’s Intra-Asian Trade and Migration in the 1930s”, History Research, 8(1), pp. 19-32. (doi: 10.11648/j.history.202008)
• Man-houng Lin, Jul. 2019, “Buddha versus State: Imperial China’s Perception of Political Leaders on Western Currency, 91BC-1911”, Researches in Chinese Economic History, 137 (Issue 02, 2018), pp. 5-22. (CNKI)
• Man-houng Lin, Apr. 2019, “Asia-Pacific Powers in Maritime Asia, 1850-1972: A Perspective from Taiwan”, International Relations and Diplomacy, Vol. 7, No. 04, pp. 162-171.
• 林滿紅，2019年1月，〈貨幣と図案と国家：中華民国の台湾化，1945-2002〉，《アジア太平洋討究》，第35號，東京：早稻田大學アジア太平洋研究センター，頁146-159. (https://doi.org/10.57278/wiapstokyu.35.0_146)
• 林滿紅，2018年3月，〈兩千年間的「佛」與「國」：傳統中國對西方貨幣領袖頭象的認知〉，《中國經濟史研究》，2018年第2期，北京：中國社會科學院經濟研究所，頁5-22。
• Man-houng Lin, Oct. 2017, “Money, Images, and the State: Taiwanization of the ROC, 1945-2000”, Twentieth Century China, 42(3), pp. 274-296.
• 林滿紅，2017年9月，〈亞太歷史、臺灣與南海——中日和約中的「南沙群島、西沙群島」〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第97卷，頁1-43。
• Man-houng Lin, Oct. 2016, “The ‘Greater East Asia Co-prosperity Sphere’: A New Boundary for Taiwanese People and the Taiwanese Capital, 1940-1945”, Translocal Chinese: East Asian Perspectives, 10, pp. 175-206.
• 林滿紅，2016年10月，〈晚清的鴉片稅，1858-1906〉，《國家航海》，第16卷第3期，上海：中國航海博物館，頁31-81。
• Man-houng Lin, May. 2014, “Taiwan and the Ryukyus (Okinawa) in Asia-Pacific Multilateral Relations – a Long-term Historical Perspective on Territorial Claims and Conflicts” (アジア太平洋地域の多国間関係における台湾と琉球諸島（沖縄）領土権主張や紛争を長期的視野とらえる), The Asia-Pacific Journal: Japan Focus, Vol. 11, 21(3), pp. 1-11.
• Man-houng Lin, Jun. 2011, “Taiwan, Manchukuo, and the Sino-Japanese War”, Asian Social Science, 7:6, pp. 51-65.
• Man-houng Lin, Sept. 2010, “Taiwan, Hong Kong, and the Pacific, 1895-1945”, Modern Asian Studies, 44(5), pp. 1053-1080. (SSCI) (IF: 1.075; SSCI ranking: 54.8%)
• 林滿紅，2010年6月，〈臺日歷史關係〉，《國史館館訊》，第4期，頁2-14。
• 林滿紅，2010年2月，〈東アジア海域上の琉球と台湾（1950-1961年）〉（Ryukyu and Taiwan on the East Asian Seas），《アジア文化交流研究》，第5號，吹田：關西大學アジア文化交流研究センター，頁487-492。
• 林滿紅，2009年3月，〈台湾の対日貿易における政府と商人の関係（1950-1961年）：政権移行と経済エリートの断続〉（Elite Survival and Regime Transition: Government-merchant relations in the Trade between Taiwan and Japan, 1950-1961），《アジア文化交流研究》，第4號，吹田：關西大學アジア文化交流研究センター，頁509-533。
• Man-houng Lin, 2009, “Social Phobias in World History: From Witch Hunt and Soulstealers to the “Identity” Crisis in Taiwan”, Chinese Studies in History, 42(4), Summer, pp. 36-43.
• Man-houng Lin，2008年12月，〈The Shift of Colonial Discourse of Academia Historica, 1957 to the Present〉，《國史館館訊》，第1期，頁30-39。
• 林滿紅，2008年12月，〈逐漸浮現的太平洋〉，《海洋文化學刊》，第5期，基隆：國立海洋大學海洋文化研究所，頁1-16。
• 林滿紅，2008年3月，〈日本政府と台湾籍民の対東南アジア投資（1895-1945）〉（Japanese Government and Taiwanese Merchants’ Southeast Asian Investment），《アジア文化交流研究》，第3號，吹田：關西大學アジア文化交流研究センター，頁455-485。
• 林滿紅，2006年12月，〈東亞海域上的琉球與臺灣〉，《歷史月刊》，第227期，頁52-56。
• Man-houng Lin, Oct. 2006, “Ryukyu and Taiwan on the East Asian Seas”, Japan Focus, 4(10), pp. 1-7. (https://apjjf.org/lin-man-houng/2258/article)
• 林滿紅，2006年3月，〈中国産アヘンの販売市場（1870年代～1906年）〉（China’s Native Opium Market, 1870s-1906），《東方學報》，第78期，京都：京都大學人文科學研究所，頁241-278。
• 林滿紅，2005年，〈世界史中的社會恐懼：從獵巫、叫魂到臺灣的認同危機〉，《歷史月刊》，第207期，頁80-89。
• 林滿紅，2005年，〈清末臺灣與中國大陸貿易型態之比較研究，1868-1894〉（簡體中文版），《近代中國》，第15期，上海：中山學社，頁161-196。
• 林滿紅，2004年9月，〈日本統治時代台湾経済史の研究：視角と視野〉（Various perspectives of the study of Taiwan’s economic history of Japanese colonial Taiwan）（日文版），《地域總合研究》，第32卷第1號，頁121-150.
• Man-houng Lin, Jun. 2004, “Late Qing Perceptions of Native Opium”, Harvard Journal of Asiatic Studies, 64(1), pp. 117-144.
• 林滿紅，2002年4月，〈界定臺灣主權歸屬的國際法——簽訂於五十年前的《中日和約》〉，《近代中國》，第148期，頁63-72。
• Man-houng Lin, 2002年3月，〈Taiwanese Merchants, Overseas Chinese Merchants, and Japanese Government: Taiwan’s Economic Relation with Japan, 1895-1945〉，《アジア太平洋討究》，第4號，東京：早稻田大學アジア太平洋研究センター，頁3-20。
• 林滿紅，2001年12月，〈日本殖民時期臺灣與香港經濟關係的變化：亞洲與世界關係調動中之一發展〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第36期，頁45-115。(THCI)
• 林滿紅，2001年11月，〈臺灣海峽兩岸歷史關係的誤解與紓解〉，《歷史月刊》，第166期，頁52-59。
• Lin, Man-houng, Oct. 2001, “Overseas Chinese Merchants and Multiple Nationality: A means for Reducing Commercial Risk (1895-1935)”, Modern Asian Studies, 35,985-1009. (SSCI) (IF: 1.075; SSCI ranking: 54.8%)
• 林滿紅，2001年6月，〈台湾海峡両岸関係をめぐる誤解を糾す〉（An analysis of the misunderstanding of the historical relation between Taiwan and Chinese mainland），《世界》，第689號，東京：岩波書店，頁305-316。
• 林滿紅，2001年3月，〈華商と多重国籍——商業的リスクの軽減手段として〉（Overseas Chinese merchants and the multiple nationalities: the means to ease commercial risk），《アジア太平洋討究》，第3號，東京：早稻田大學アジア太平洋研究センター，頁95-112。
• 林滿紅，1999年12月，〈日本政府與臺灣籍民的東南亞投資，1895-1945〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第32期，頁1-56。(THCI)
• 林滿紅，1998年6月，〈「大中華經濟圈」概念之一省思——日治時期台商之島外經貿經驗〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第29期，頁47-101。(THCI)
• Man-houng Lin, Spring-Summer 1998, “Interpretive Trends in Taiwan Scholarship on Chinese Business History: 1600 to the Present”, Chinese Studies in History, 31(3-4), pp. 65-94 (亦收入 1998, editor(s): Robert Gardella, Andrea McElderry, Jane Kate Leonard, Chinese Business History, Interpretive Trends and Priorities for the Future, Ch.4, pp. 65-94, New York: M. E. Sharpe).
• 林滿紅，1998年秋季，〈有等級區分的均富思想：論中國文化的一個關鍵概念及其在臺灣歷史中的實現〉，《香港社會科學學報》，第12期，頁101-129。
• 林滿紅，1997年12月，〈與岸本教授論清乾隆年間的經濟〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第28期，頁235-252。
• 林滿紅，1997年8月，〈以世界框架寫中國人的近代史〉，《當代》，第120期，頁38-51。
• 林滿紅，1996年7月，〈有關日據時期臺灣經濟史的四種誤解〉，《臺灣社會研究季刊》，第23期，頁147-157。
• 林滿紅，1996年7月，〈與兩岸問題相關的幾個歷史觀〉，《歷史月刊》，第102期，頁36-40。
• 林滿紅，1996年6月，〈當代臺灣的史學與社會〉，《教學與研究》，第18期，頁69-98。
• 林滿紅，1995年6月，〈臺灣與東北間的貿易，1932-1941〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第24期，頁653-696。(THCI)
• 林滿紅，1994年7月，〈清末大陸來台交商的興衰——台灣史、中國史、世界史之一結合思考〉，《國家科學委員會研究集刊：人文及社會科學》，第4卷第2期，頁173-193。
• 林滿紅，1994年6月，〈嘉道年間貨幣危機爭議中的社會理論〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第23期，頁161-203。
• 林滿紅，1993年9月，〈自由放任經濟思想在十九世紀初葉中國的昂揚〉，《中國歷史學會中國歷史學會史學集刊》，第25期，頁201-226。
• 林滿紅，1993年6月，〈銀與鴉片的流通及銀貴錢賤現象的區域分佈，1808-1854——世界經濟對近代中國空間方面之一影響〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第22期（上），頁89-135。
• 林滿紅，1992年2月，〈中國傳統經濟的特徵〉，《人文社會科學通訊》，第2卷第5期，頁59-108。
• Man-houng Lin, Dec. 1991, “A Time in Which Grandsons Beat Their Grandfathers’: The Rise of Liberal Political-economic Ideologies in the Monetary Crisis of the Early Nineteenth-century China”, American Asian Review, pp. 1-28.
• Man-houng Lin, 1991, “Two Social Theories Revealed: Statecraft Controversies over China’s Monetary Crisis, 1808-1854”, Late Imperial China, 12(2), pp. 1-35.
• 林滿紅，1990年12月，〈古文與經世：十九世紀初葉中國兩派經世思想的分殊基礎〉，《臺大歷史學報》，第15期，頁239-262。
• 林滿紅，1985年12月，〈光復以前臺灣對外貿易之演變〉，《臺灣文獻》，第36卷第3、4期，頁53-65。
• 林滿紅，1980年7月，〈清末本國鴉片之替代進口鴉片，1858-1906——近代中國「進口替代」個案研究之一〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第9期，頁385-432。(THCI)
• 林滿紅，1980年6月，〈史學與價值判斷——推介薩著《中國社會政治史》〉，《教學與研究》，第2期，頁205-222。
• 林滿紅，1979年7月，〈日據時代臺灣經濟史研究之綜合評介〉，《史學評論》，第1期，頁161-209。
• 林滿紅，1979年7月，〈貿易與清末臺灣的經濟社會變遷，1860-1895〉，《食貨月刊》，復刊第9卷第4期，頁18-32。
• 林滿紅，1979年2月，〈對外匯率長期下跌對清末國際貿易與物價之影響，1874-1911〉，《教學與研究》，第1期，頁147-176。
• 林滿紅，1979年1月，〈晚清的鴉片稅，1858-1906〉，《思與言》，第16卷第5期，頁427-475。
• 林滿紅，1978年5月，〈清末臺灣與我國大陸之貿易形態比較，1860-1894〉，《國立臺灣師範大學歷史學報》，第6期，頁209-244。(THCI)
• 林滿紅，1977年9月，〈晚清臺灣茶、糖、樟腦業之產銷組織〉，《臺灣銀行季刊》，第28卷第3期，頁200-220。
• 林滿紅，1977年12月，〈茶、糖、樟腦業對晚清臺灣經濟社會之影響〉，《臺灣銀行季刊》，第28卷第4期，頁249-273。
• 林滿紅，1972年9月，〈封建制度在盎格魯薩克森社會的萌芽，449-1066〉，《史繹》，第9期，頁25-44。
• 林滿紅，1971年8月，〈由中西史料看光緒十至十一年之法軍侵臺〉，《史繹》，第8期，頁22-55。

專書(論文集)之一章

• Lin Man-Houng, Dec. 2019, “Culture, Market, and State Power: Taiwanese Investment in Southeast Asia, 1895-1945”, editor(s): Chi-cheung Choi, Takashi Oishi, Tomoko Shiroyama, Chinese and Indian Merchants in Modern Asia Networking Businesses and Formation of Regional Economy, pp. 258─281, Leiden: Brill.
• 林滿紅，2018年12月，〈逐漸浮現的太平洋〉，陳明銶、鮑紹霖、麥勁生及區志堅編，《中國與世界》，頁209-229，香港：香港城市大學出版社。
• Man-houng Lin, May. 2018, “A Neglected Treaty for the South China Sea”, editor(s): Spencer T.S. Hsieh, South China Sea Disputes: Historical, Geopolitical and Legal Studies, pp. 1-24, Singapore: World Scientific Publishing.
• 林滿紅，2017年3月，〈1930年代臺灣在亞洲內部的貿易與移民〉，黃自進、潘光哲編，《近代中日關係史新論》，頁747-778，新北市：稻香出版社。
• 林滿紅，2016年9月，〈現代經濟的起步：晚清的經濟發展〉，王建朗、黃克武編，《2016兩岸新編近代史：晚清卷》，頁549-584，北京：社會科學文獻出版社。
• 林滿紅，2016年8月，〈國際貿易關係中的中國二元經濟（1842-1949）(中文簡體字版)〉，王玉茹、吳柏均、劉蘭兮編，《經濟發展與市場變遷—吳承明先生百年誕辰紀念文集》，頁114-128，天津：南開大學出版社。
• 林滿紅，2015年7月，〈戰爭、和約與臺灣〉，呂芳上編，《中國抗日戰爭史新編》，頁465-522，臺北：國史館。 (The Resistance War, Peace Treaty and Taiwan)
• Lin, Man-houng, Mar. 2015, “The Devastation of the Qing Mints, 1821-1850”, editor(s): Jane Kate Leonard and Ulrich Theobald. Ed., Money in Asia (1200 – 1900): Small Currencies in Social and Political Contexts, pp. 155-187, Leiden: Brill Co..
• Lin, Man-houng, Jan. 2015, “Taiwan’s Sovereignty Status ：The Neglected Taipei Treaty”, editor(s): Mark Selden and Kimie Hara ed., The San Francisco System and Its Legacies: Continuation, Transformation, and Historical Reconciliation in the Asia-Pacific, pp. 115-143, London and New York: Routledge.
• Lin, Man-houng, 2015, “The May 26, 1971 Note from the US on the Diaoyutai Issue: Taiwan’s Sovereignty Claim and the US Response”, editor(s): Tim F. Liao, Krista Wiegand,and Kimie Hara,ed., China and Japan Border Disputes: Islands of Contention in Multidisciplinary Perspective, pp. 57-81, London: London: Ashgate.
• 林滿紅，2014年9月，〈台湾から見た釣魚台問題〉，高原明生、菱田雅晴、村田雄二郎、毛里和子編編，《日中関係　何が問題か──一九七二年体制の再検証》，頁79-86，東京：岩波書店。 (The Diaoyutai issue viewed from Taiwan)
• Lin, Man-houng, Jul. 2014, “The Characteristics of China’s Traditional Economy”, editor(s): Gregory C. Chou and Dwight H. Perkins ed., Routledge Handbook of the Chinese Economy, pp. 01-20, London and New York: Routledge.
• 林滿紅、梁啟源、鄭睿合，2014年2月，〈銀價貶值與清末中國的國際貿易收支（1874-1911）〉，復旦大學歷史地理研究中心、哈佛大學哈佛燕學社編編，《“國家視野下的地方”國際學術研討會論文集》，頁53-65，上海：上海人民出版社。 (Silver depreciation and the foreign trade balance in Late Qing China, 1874-1911)
• 林滿紅，2013年11月，〈政權移轉與精英絕續──台灣對日貿易中的政商合作（1950-1961）〉，李培徳編，《大過渡：時代變局中的中國商人》，頁156-201，香港：商務印書館(香港)有限公司。
• 林滿紅, 2013, “中国産アヘンの販売市場─1870年代~1906年”, editor(s): 古田和子, 中国の市場秩序-17世紀から20世紀前半を中心に, pp. 85-134, 東京: 慶應義塾大學.
• 林滿紅，2012年12月，〈高中歷史教科書以《中日和約》定位臺灣〉，中華民國外交部編，《主權在我───《中日和約》六十週年之時代意義》，頁34-39，台北：中華民國外交部。
• 林滿紅，2011年12月，〈數位化：史學與社會結合的一大契機〉，項潔編，《數位人文在歷史學研究的應用》，頁45-69，臺北：台大出版中心。
• 林滿紅，2011年5月，〈1930年代台湾のアジア域内における貿易と移民〉，岩波書店編，《岩波講座　東アジア近現代通史》，頁151-172，東京：岩波書店。
• Lin, Man-houng, 2011, “The Power of Culture and Its Limits: Taiwanese Merchants’ Asian Commodity Flow, 1895–1945”, editor(s): Eric Tagliacozzo, Wen-Chin Chang, Chinese Circulations: Capital, Commodities and Networks in Southeast Asia, pp. 305-335, Durham: Duke University Press.
• 林滿紅，2010年7月，〈중화제국 후기의 상업문화 특징（中華帝國後期商業文化的特徵）〉，박기수（朴基水等編）編，《중국 전통상인과 근현대적 전개（中國傳統商人與近代的展開）》，頁55-87，韓國：한국학술정보（주）韓國學術情報（株）。
• Lin, Man-houng, 2010, “The Survival of Economic Elites during Regime Transition: Government-Merchant Cooperation in Taiwan’s Trade with Japan, 1950-1961”, editor(s): Shigeru Akita and Nicholas J. White eds., International Order of Asia in the 1930s and 1950s: Contexts, Hypotheses and Scope, pp. 275-301, London and New York: Ashgate.
• 林滿紅，2010年，〈日台経済関係における台湾人商人、華商、日本政府（一八九五-一九四五）〉，貴志俊彦編，《変容する国際社会と「外国人」問題― 一九世紀-二〇世紀の日本・東アジア・東南アジア―》，頁59-82，東京：御茶の水書房。 (Japanese government, overseas Chinese, and the Taiwanese merchants, 1895-1945)
• 林滿紅，2008年1月，〈傳統儒家思想與你：儒家思想有反商情結嗎？〉，李誠編，《生活經濟學》，頁285-306，台北：天下遠見。
• 林滿紅，2007年12月，〈日本の海運カと「僑郷」の紐帯－―九三〇年代の台湾－滿洲間貿易を中心に〉，松浦正孝編，《昭和・アジア主義の実像－帝国日本と台湾・「南洋」・「南支那」》，頁344-371，京都：ミルヴア書房。
• 林滿紅，2007年12月，〈清末自產鴉片之替代進口鴉片（1805-1906）〉，中村哲編，《近代東亞經濟的歷史結構》，頁63-117，臺北：中央研究院人文社會科學研究中心亞太區域研究專題中心。
• Lin, Man-houng, May. 2007, “Qiaoxiang Ties versus Japanese Maritime Power: Trade between Taiwan and Manchuria, ca. 1932-1939”, editor(s): Leo Suryadinata, ed., Chinese Diaspora, Since Admiral Zheng He, with Special Reference to Maritime Asia, pp. 137-159, Singapore: Chinese Heritage Center.
• 林滿紅，2007年3月，〈清末における国産アヘンによる輸入アヘンの代替(1805-1906) ——近代中国における「輸入代替」の一事例研究——〉，中村哲編，《近代東アシア経済の構造》，頁57-107，東京：日本評論社。 (the import-substitution of the Chinese native opium in the late Qing period: a case of import –substitution in modern China)
• 林滿紅，2006年11月，〈晚清土產鴉片的運銷市場〉，李國祁教授八秩壽慶論文集編輯小組編，《近代國家的應變與圖新》，頁127-169，臺北：唐山出版社。
• 林滿紅，2006年6月，〈附屬與自主之間：日本殖民時期台商的台日經貿活動〉，朱蔭貴、戴鞍鋼編，《近代中國：經濟與社會研究》，頁46-87，上海：復旦大學出版社。
• 林滿紅，2006年2月，〈大東亜共栄圏：台湾人と台湾資金の新たな境界〉，中村哲編，《1930年代の東アジア経済：東アジア資本主義形成史Ⅱ》，頁41-74，東京：日本評論社。 (The Greater East Asia Co-prosperity Sphere: The New Boundary of Taiwanese People and Taiwanese Capital)
• 林滿紅，2006年2月，〈貿易與清末臺灣的經濟社會變遷，1860-1895〉，吳松弟主編，林滿紅、戴鞍鋼副主編編，《中國百年經濟拼圖：港口城市及其腹地與中國現代化》，頁103-158，濟南：山東畫報出版社(簡體中文版)。
• 林滿紅，2005年1月，〈日本殖民時期台灣與香港經濟關係的變化─亞洲與世界關係調動中之一發展（簡體中文版）〉，中國社會科學院近代史研究所編，《近代中國與世界：第二屆近代中國與世界學術討論會論文集》，頁622-682，北京：社會科學文獻出版社。
• 林滿紅，2005年1月，〈日本殖民時期臺灣與香港經濟關係的變化：亞洲與世界關係調動中之一發展〉，中國社會科學院近代史研究所編，《近代中國與世界：第二屆近代中國與世界學術討論會論文集》第二卷，頁622-682，北京：社會科學文獻出版社 (簡體中文版)。
• Lin, Man-houng, 2005, “Taiwanese Merchants in the Economic Relations between Taiwan and China, 1895-1937”, editor(s): Kaoru Sugihara, Japan, China, and the Growth of the Asian International Economy, 1850-1949., pp. 217-243, Oxford: Oxford University Press.
• Lin, Man-houng, 2005, “The Development of ‘Dual Economy’ in China’s Fluctuating International Trade Relations, 1842-1949”, editor(s): Kaoru Sugihara, Japan, China, and the Growth of the Asian International Economy, 1850-1949, pp. 179-197, Oxford: Oxford University Press.
• 林滿紅，2005年，〈口岸貿易與腹地變遷：近代中國的經驗（1860年代至1930年代）〉，復旦大學中國歷史地理研究中心主編編，《港口─腹地和中國現代化進程》，頁14-26，山東：齊魯書社 (簡體中文版)。
• 林滿紅，2005年，〈台湾学者の近代華商歴史論：学術環境と解釈の趨勢〉，中村哲編，《1930年代の東アジア経済》，頁23-51，東京：日本評論社。 (Taiwan scholars’ interpretations of Chinese merchants’ history in modern period)
• 林滿紅，2005年，〈臺灣學者論近代華商歷史：學術環境與解釋趨勢〉，中村哲編，《東亞近代經濟的形成與發展》，頁31-72，臺北：中研院人社中心亞太區域研究中心。
• Lin, Man-houng, 2004, “The Shift from East Asia to the World: The Role of Maritime Silver in China’s Economy in the Seventeenth to Late Eighteenth Centuries”, editor(s): Wang Gungwu and Ng Chin-keong eds., Maritime China in Transition, 1750-1850, pp. 77-96, Wiesbaden,Germany: Harrassowitz.
• Lin, Man-houng, 2004, “Yang’an yôksa kwan’gae ûi ohae wa ihae” 양안 （Cross-Strait）　역사　관계의 오해와 이해 ”, editor(s): Chông Mun Kil정문길, Choi Wôn Sik최원식, Baek Yông Sô백영서, and Chôn Hyông Chun전형준, Chubyôn aesô pon tong Asia 주변에서 본 동아시아, pp. 64-85, Seoul: Munhakkwa chisôngsa문학과 지성사.
• 林滿紅，2002年5月，〈太平洋経済における台湾・香港間の競合関係－日本植民地期における台湾の経験〉，關西大學東西學術研究所共同研シリズ編，《福建と日本》，第425號，頁209-265，大阪：關西大學。 (The competition and cooperation between Taiwan and Hong Kong: Taiwan’s experience under Japanese colonial rule)
• Man-houng, Lin, 2001, “Decline or Prosperity? Guild Merchants Trading Across the Taiwan Straits, 1820s-1895（英文節縮版）”, editor(s): Sinya Sugiyama, Linda Grove, Commercial Networks in Modern Asia, pp. 116-139, London: Curzon Press Richmond, Surrey.
• 林滿紅，2001年，〈日本殖民地期台灣の對滿州貿易促進とその社會的意義(1932-1941)〉，秋田茂、籠谷直人編，《一九三○年代東亞的世界秩序》，頁123-143，廣島：溪水社。
• 林滿紅，1999年6月，〈財經安穩與國民健康之間：晚清的土產鴉片論議(1833-1905)〉，中央研究院近代史研究所社會經濟史組編編，《財政與近代歷史論文集》，頁501-551，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 林滿紅，1999年5月，〈臺灣商業經營的中國傳承與蛻變─以近四十年臺灣相關研究為基礎之省察〉，中央研究院臺灣史研究所籌備處編，《臺灣商業傳統論文集》，頁3-44，臺北：中央研究院臺灣史研究所籌備處。
• 林満紅，1999年3月，〈「大中華經濟圈」概念の一考察─日本統治時代の台灣商人の活動〉，飯島涉編，《華僑‧華人史研究の現在》，頁185-228，東京：汲谷書院。 (An examination of the concept of the “Great China economic sphere”: the activities of Taiwanese merchants under Japanese rule)
• 林滿紅，1999年3月，〈印尼華商、臺商與日本政府之間：臺茶東南亞貿易網絡的拓展(1895-1919)〉，湯熙勇編，《中國海洋發展史論文集，第7輯》，頁585-636，臺北：中央研究院中山人文社會科學研究所。
• 林滿紅，1999年1月，〈黑潮文明經濟圈的歷史與文化：臺日關係篇〉，許光泰編，《亞洲共同課題的挑戰》，頁68-103，臺北：國立政治大學國際關係研究中心。 (History and culture of the economic sphere of the Kuroshio civilization: the chapter of Taiwan-Japan relations)
• 林滿紅，1999年，〈開港後の台灣と中國の經濟關係 (1860-95) 〉，杉山伸也、Linda Grove編，《近代アジアの流通ネツトワ—ク》，頁117-136，東京：創文社。 (Sugiyama Sinya, Linda Grove, 1999, “Economic relations between Taiwan and mainland China after the opening of treaty ports”, The circulation network of modern Asia, 東京: 創文社)
• Lin, Man-houng, 1998, “Economic Ties Between Taiwan and Mainland China, 1860-1895： Strengthening or Weakening?”, editor(s): Hao Yan-p'ing and Wei Hsiu-mei ed., Tradition and Metamorphosis in Modern China, Symposium in Commemoration of Prof. Liu Kwang-Ching’s 75th birthday, pp. 1067-1089, Taipei: the Institute of Modern History, Academia Sinica.
• 林滿紅，1996年3月，〈中日關係之一糾結：1932至1941年間臺灣與東北貿易加強的社會意涵〉，中央研究院近代史研究所編，《第三屆「近百年中日關係」學術研討會會議論文集》，頁485-526，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 林滿紅，1995年9月，〈清末臺灣海關歷年資料的史料價值〉，張炎憲、陳美蓉、黎中光編，《臺灣史與臺灣史料（二）》，頁353-366，臺北：吳三連基金會。
• 林滿紅，1995年9月，〈經貿與政治文化認同—─ 日本領臺為兩岸長程關係投下的變數〉，學術研討會籌備委員會編，《中國歷史上的分與合學術研討會論文集》，頁333-384，臺北：聯經出版公司。
• Lin, Man-houng, 1995, “World Recession, Indian Opium, and China’s Opium War”, editor(s): K. S. Mathew ed., Mariners, Merchants, and Oceans, Studies in Maritime History, pp. 385-417, New Delhi: Manohar Publisher & Distributors.
• 林滿紅，1993年10月，〈臺灣資本與兩岸經貿關係──臺商拓展外貿經驗之一重要篇章〉，宋光宇編，《臺灣經驗──歷史經濟篇》，頁67-139，臺北：東大圖書公司。
• 林滿紅，1991年3月，〈中國的白銀外流與世界金銀減產，1814-1850〉，中央研究院中山人文社會科學研究所編，《第四屆中國海洋發展史會議論文集》，頁1-44，臺北：中央研究院中山人文社會科學研究所。
• Lin, Man-houng, 1991, “The Perpetuation of Bloodline Versus Family Property: A Crucial Factor for the Different Demographic Dynamics of Pre-industrial China and Japan”, editor(s): The Institute of Modern History, Academia Sinica, Symposium on the Modernization in China, pp. 165-208, Taipei: The Institute of Modern History, Academia Sinica.
• 林滿紅，1990年12月，〈明清的朝代危機與世界經濟蕭條—─ 十九世紀的經驗〉，中國社會科學院近代史研究所編，《「近代中國與世界」國際學術研討會論文集》，頁358-368，北京：(中國社會科學院近代史研究所；《新史學》，第1卷第4期，1990年12月，頁127-147)。
• Lin, Man-houng, 1990, “From Sweet Potato to Silver: The New World and Eighteenth-century China as Reflected in Wang Hui-tsu’s Passage About the Grain Prices”, editor(s): Hans Pohl ed., The European Discovery of the World and Its Economic Effects on the Pre-industrial Society, pp. 304-327, Stuttgart Germany: Franz Steiner Verlag.
• 林滿紅，1989年12月，〈世界經濟與近代中國農業─清人汪輝祖一段乾隆糧價記述之解析〉，中央研究院近代史研究所編，《近代中國農村經濟史論文集》，頁291-325，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 林滿紅，1986年12月，〈口岸貿易與近代中國─ 臺灣最近有關研究之回顧〉，中央研究院近代史研究所編，《近代中國區域史研討會論文集》，頁869-915，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 林滿紅、孫震、梁啟源，1983年，〈戰後復員與物價膨脹〉，秦孝儀編，《中華民國經濟發展史》，頁737-1014，臺北：近代中國出版社。
• 林滿紅、呂實強，1983年，〈現代經濟的起步──清代的經濟發展，1840-1911〉，秦孝儀編，《中華民國經濟發展史》，頁1-62，臺北：近代中國出版社。

他類論文

• 林滿紅，2024年5月，〈沖繩不是「託管」：了解歷史 讓台灣、沖繩共免戰爭〉（Okinawa Was Not a Trust Territory: Understanding History So Taiwan and Okinawa Can Avoid War），《聯合報》，A12。
• 林滿紅，2024年2月，〈有效統治、台北和約：中華民國有太平島主權〉（Effective Governance and the Taipei Peace Treaty: ROC Holds Sovereignty over Taiping Island），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2023年11月，〈歷史課綱應還原開羅宣言的意義〉（The Significance of the Cairo Declaration Should Be Restored in the History Curriculum），《聯合報》，A10。
• 林滿紅，2023年10月，〈中華民國雙十國慶快樂：國名是什麼？中華民國與台灣之間，台北和約已釐清〉（Happy National Day to the Republic of China），《聯合報》，A10。
• 林滿紅，2023年5月，〈三道程序確立台歸屬〉（Three Process Establish ROC Sovereignty Over Taiwan），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2023年4月，〈蔣中正值得紀念、展覽應活化〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，2022年9月，〈讀王毅在聯合國有關臺灣的發言：遵國際法應正視中華民國〉（Reading Wang Yi's UN Address on Taiwan），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2022年8月，〈中華民國為中華人民共和國完全繼承？國史館可化解社會質疑〉（Academia Historica Can Overcome Public Criticism），《聯合報》，A11。
• 林滿紅、余亭翰，2022年6月，〈解讀中共思維：何以友臺成干涉中國內政？兩岸相互尊重才能「求同存異」〉（Interpreting CCP Thought: Why Friendship with Taiwan Becomes Interference in China's Domestic Affairs “Seeking commonalities while retaining differences” can only be obtained by mutual respect across the Strait），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2022年5月，〈臺北和約─立法院立的法，談臺灣主權卻不提這一條約〉（The Taipei Peace Treaty: Law Established by the Legislative Yuan），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2022年5月，〈臺北和約界定臺領土主權〉（The Taipei Peace Treaty: Defining Taiwan's Territorial Sovereignty），《聯合報》，A13。
• 林滿紅，2022年4月，〈臺北和約70年：臺灣主權未定嗎〉（70 Years Since the Treaty of Taipei, Is Taiwan's Sovereignty Still Unsettled?），《聯合報》，A11。
• 林滿紅，2022年2月，〈習普會、臺主權與近代條約〉（Xi-Putin Summit: Taiwanese Sovereignty and Modern Treaties），《聯合報》，A11。
• 林滿紅，2021年11月，〈4政治文件與中日臺美關係〉（The Four Political Documents and China-Japan-Taiwan-US Relations），《聯合報》，A11。
• 林滿紅，2019年12月，〈《臺北和約》中的胡慶育——以南沙、西沙群島為核心〉，《泰宇UP誌歷史專刊》，26，頁1-7。
• 林滿紅，2019年1月，〈積弱再興中國 可有的選項 讓兩岸同為聯合國會員國〉，《聯合報》，A16。
• 林滿紅，2018年10月，〈中日台共同開發 解釣魚台爭議〉，《聯合報》，A12。
• 林滿紅，2018年1月，〈從時間座標看 臺灣屬中華民國〉，《聯合報》，A12。
• 林滿紅，2017年11月，〈論台灣法統 莫忘中日和約〉，《聯合報》，A16。
• 林滿紅，2017年7月，〈台灣國際地位「確立過程」不見了〉，《聯合報》，A15。
• 林滿紅，2017年4月，〈貨幣圖案與國家意象：中華民國在臺灣的發展，1945-2000〉，《中央研究院週報．知識天地》，第1612期。
• 林滿紅，2016年8月，〈南海主權 在1858不在2758〉，《聯合報》，A10。
• 林滿紅，2016年7月，〈太平島歷史文獻 記載水豐宜居〉，《聯合報》，A12。
• 林滿紅，2016年7月，〈舊海關資料與近代中國史研究〉，《文匯報》。
• 林滿紅，2016年2月，〈中日和約 重要南海法律基礎〉，《聯合報》，A14。
• 林滿紅，2015年9月，〈只談國共，盟國何在〉，《蘋果日報》，A15。
• 林滿紅，2015年6月，〈憲法一中 也在中日和約裡〉，《聯合報》，A14。
• 林滿紅，2014年12月，〈缺乏國家意志的台灣〉，《中國時報》，A13。
• 林滿紅，2014年11月，〈亞太多邊關係中的台灣與琉球（沖繩）——一個歷史角度的觀察〉，《中央研究院週報．知識天地》，第1492期，頁3-6。
• 林滿紅，2014年11月，〈族群不應對立 法律早有規定！〉，《聯合報》，A16。
• 林滿紅，2013年12月，〈釣魚台主權歸中華民國 法理有據〉，《中國時報》，A14。
• 林滿紅，2009年11月，〈台湾はどこへ向かうのか——東アジアの新たな可能性を求めてII：歴史の中の日台関係〉，《世界》，第797號，東京：岩波書店，頁267-270。
• Man-houng Lin, 2009, ““Opium Trade” & “Silver” in Linsun Chen and others eds”, Berkshire Encyclopedia of China, N/A, 1662-66,1981-81.
• Man-houng Lin, Nov. 2007, “Future Possibilities for the Relation between Taiwan and the UN”, Academia Sinica's E-news.
• Man-houng Lin, Nov. 2007, “Future Possibilities for the Relation between Taiwan and the UN”, Academica Sinica's E-news.
• 林滿紅，2007年11月，〈臺灣與聯合國關係之前瞻〉，《中央研究院週報．知識天地》，第1144期，頁3-5。
• Man-houng Lin, Sept. 2007, “What Country Do You Want to lead”, Taipei Times.
• 林滿紅，2006年9月，〈臺灣不要變成琉球王國〉，《蘋果日報》。
• 林滿紅，2006年8月，〈東亞海域上的琉球與臺灣〉，《中央研究院週報．知識天地》，第1084期，頁4-6。
• 林滿紅，2004年11月，〈有關臺灣地位的片語絮言〉，《蘋果日報》。
• 林滿紅，2002年4月，〈界定台灣主權歸屬的國際條約——簽定於五十年前的《中日和約》〉，《自由時報》。
• 林滿紅，2001年4月，〈台灣不是香港，也不是澳門〉，《聯合報》，A15。
• 林滿紅，2000年6月，〈糾纏「一個中國」實屬多餘〉，《交流》，第51卷，頁35-36。
• 林滿紅，2000年5月，〈「兩岸關係不等於國共關係」的宣示〉，《聯合報》，A15。
• 林滿紅，1996年7月，〈以世界框架 重建中國人的歷史記憶〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，1995年12月，〈兩岸因農業而分，請也讓兩岸因農業而合——兩岸「農業合作」規劃案〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，1995年10月，〈全民寫史運動的一個起點〉，《經濟日報》，A25。
• 林滿紅，1995年6月，〈臺灣經濟發展源起於日治時期？——談有關日治時期臺灣經濟史的四種誤解〉，《工商時報》。
• 林滿紅，1995年4月，〈兩岸合作 不能忽略結構性的分歧〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，1994年11月，〈中國人 不要再自己打自己〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，1994年11月，〈兩岸分歧 是日據時代鋪的路〉，《聯合報》，A11。
• 林滿紅，1994年7月，〈一八九五年——兩岸關係史上的重要年份〉，《聯合報》。
• 林滿紅，1994年3月，〈通訊報導：會議報導：亞洲商業網路，1850-1930〉，《近代中國史研究通訊》，第17期，頁20-29。
• 林滿紅，1992年10月，〈通訊報導：出席「文化、宗教與中國經濟發展會議」報告〉，《中央研究院學術諮詢總會通訊》，第1卷第4期。
• 林滿紅，1990年3月，〈研究概況：Papers on China〉，《近代中國史研究通訊》，第9期，頁46-56。
• 林滿紅，1989年9月，〈通訊報導：學人簡介：Philip Alden Kuhn〉，《近代中國史研究通訊》，第8期，頁18-26。
• 林滿紅，1986年9月，〈通訊報導：會議報導：近代中國區域史研討會〉，《近代中國史研究通訊》，第2期，頁3-15。

學術書評

• Man-houng Lin, Dec. 2012, “Book Reviews: Jason Lim. Linking an Asian Transregional Commerce in Tea: Overseas Chinese Merchants in the Fujian-Singapore Trade, 1920–1960. Leiden: Brill NV, 2010, 252 p. Southeast Asian”, Southeast Asian Studies, 1(3), pp. 533-536.
• 林滿紅，2006年9月，〈評介赤嶺守《琉球王國》〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第53期，頁235-239。
• Man-houng Lin, Jan. 2006, “On David Bello, Opium and the Limits of Empire: Drug Prohibition in the Chinese Interior, 1729-1850”, International Journal of Asian Studies, 3(1), pp. 147-148.
• Man-houng Lin, Nov. 1993, “Review on Jane Kate Leonard and John R. Watt, ed., To Achieve Security and Wealth: The Qing Imperial State and Economy, 1644-1911, New York: Cornell East Asian Series, East Asian Program, Cornell University 1992”, Asian Studies Reviews, 17(2), pp. 187-189.
• 林滿紅，1991年3月，〈戰爭與和平：王宏斌著《晚清貨幣比價研究》之評介〉，《近代中國史研究通訊》，第11期，頁79-85。
• 林滿紅，1980年7月，〈評介張著《抗戰時期及戰後中國的通貨膨脹螺旋》——兼評周舜莘、楊格的有關研究〉，《中國現代史論集》，第9輯，頁277-309。
• 林滿紅，1980年7月，〈評介齊著《中國軍閥政治》〉，《中國現代史論集》，第5輯，頁111-119。
• 林滿紅，1979年12月，〈評介陳著《臺灣的人口變遷與社會變遷》〉，《臺灣風物》，第29卷第4期，頁87-97。