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為了強化與其他研究機構的合作交流，增進學者訪問學習與共同研究的機會，以提升全球競爭力，本所與國外多所大學及研究機構簽署了學術交流協議。目前正在進行中者，詳如下表：
● 中國北京大學歷史學系 ● 中國上海復旦大學歷史系 ● 日本東洋文庫 ● 日本京都大學人文科學研究所