專書、論文集

• 陳耀煌，2025，《近代中國農村體制的建立與演變，1900-1980年代：以滿鐵調查的村莊為中心》，共482頁，臺北：政大出版社。
• 陳耀煌，2020，《中國農村的副業、市場與共產革命，1900-1965》，共818頁，台北：中央研究院近代史研究所。
• 陳耀煌，2012，《統合與分化：河北地區的共產革命，1921-1949》，共510頁，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 陳耀煌，2002，《共產黨‧地方菁英‧農民：鄂豫皖蘇區的共產革命(1922-1932)》，共486頁，臺北：國立政治大學歷史系。

期刊論文

• 陳耀煌，2023，〈中共陝西省委的研究，1932-1942〉，《東吳歷史學報》，43, 93。(SSCI)
• 陳耀煌，2023，〈明治到昭和初年日本農村副業的發展與組織──以茨城縣為中心的探討〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，120, 41-91。(SSCI)
• 陳耀煌，2022，〈中共在陝西渭北地區的發展，1930-1933〉，《政大歷史學報》，58, 115-156。
• 陳耀煌，2022，〈革命的季節性──1950年代前期河南省農村的群眾運動〉，《新史學》，33(2), 133-189。(THCI)
• 陳耀煌，2019，〈近代日本農村統治體制的建立─兼論與中國農村的比較研究〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，106, 1-46。(THCI)
• 陳耀煌，2017，〈二十世紀中國華北農村基層領導特質的演變 —一個口述歷史的考察〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第98卷，頁49-88。(THCI)
• 陳耀煌，2016，〈河南省的農業合作化運動，1949-1962：兼與Ralph Thaxton, Catastrophe and Contention in Rural China一書商榷〉，《臺灣師大歷史學報》，第56卷，頁159-210。
• 陳耀煌，2016，〈陝西地區的共產革命，1924-1933：一個組織史的考察〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第93卷，頁41-86。
• 陳耀煌，2015，〈國家與群眾：北京市城區基層街道體制的建設，1949-1962〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，期88，頁1-53。(THCI)
• 陳耀煌，2015，〈北方地區的共產革命，1920-1927─ 一個組織史的考察〉，《新史學》，第26卷第1期，頁105-156。(THCI)
• 陳耀煌，2013，〈動員的類型：北京市郊區農村群眾運動的分析〉，《臺灣師大歷史學報》，第50期，頁155-198。(THCI)
• 陳耀煌，2013，〈集中與分權：1960年代前期北京市郊區的農村基層政權建設〉，《成大歷史學報》，第45號，頁209-252。(THCI)
• 陳耀煌，2013，〈社會主義進山村：閩西地區的社會經濟變革及其困境，1949-1965〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第81期，頁133-185。(THCI)
• 陳耀煌，2013，〈民國時期的農村社會與地方強人─傅柏翠與閩西地區〉，《東吳歷史學報》，第29期，頁59-114。(THCI)
• 陳耀煌，2013，〈1950年代北京市郊區的農村基層政權建設─兼論與1949年以前農村基層政權的比較〉，《國史館館刊》，第36期，頁51-98。(THCI)
• 陳耀煌，2012，〈在共產中國發現歷史：毛澤東時代中共農村革命史之西方研究述評〉，《新史學》，第23卷第4期，頁207-245。(THCI)
• 陳耀煌，2011，〈統籌與自給之間：中共陜甘寧邊區的財經政策與金融、貿易體系〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第72期，頁137-192。(THCI)
• 陳耀煌，2010，〈從中央到地方：三十年來西方中共農村革命史研究述評〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，期68，頁143-180。(THCI)
• 陳耀煌，2008，〈中共湘鄂西蘇區的發展及其內部整肅〉，《國史館學術集刊》，期15，頁35-76。
• 陳耀煌，2007，〈中共陜甘寧邊區的鹽業〉，《國立政治大學歷史學報》，第27輯，頁1-42。
• 陳耀煌，2004，〈中共閩西蘇區的發展及其內部整肅，1927-1931〉，《國史館學術集刊》，期4，頁33-75。
• 陳耀煌，2004，〈抗戰前中共在閩南地區發展之研究〉，《國立政治大學歷史學報》，期21，頁67-97。
• 陳耀煌，2003，〈日本中國史研究會論近代中國的轉變──以足立啟二《專制國家史論》一書為中心的探討〉，《新史學》，卷14期3，頁123-146。
• 陳耀煌，2003，〈菁英與群眾──北伐前後閩西地區的國共合作與農民暴動〉，《新史學》，卷14期1，頁97-142。
• 陳耀煌，2000，〈地方菁英與中共農民運動關係之研究──以湘鄂西蘇區早期發展為例〉，《政大史粹》，期2，頁99-125。
• 陳耀煌，2000，〈政治、史學與史家──從「漢學的陰影」一文來看1950-1980年間美國中國共產革命史研究的轉變〉，《政大史粹》，期4，頁109-145。
• 陳耀煌，1999，〈對中共鄂豫皖蘇區發展若干特點之考察(1927-1932)〉，《政大史粹》，期1，頁81-102。
• 陳耀煌，1998，〈粵東農民運動發展與中國共產黨之關係（一九二二至一九二六）〉，《近代中國》，期126，頁28-51。

專書(論文集)之一章

• 陳耀煌，2009，〈中共西北地區革命根據地的營業稅〉，中國社會科學院近代史研究所民國史研究室、《歷史研究》編輯部、四川師範大學歷史文化學院編，《1940年代的中國》，頁614-635，北京：社會科學文獻出版社。
• 陳耀煌，2008，〈中國農村地區共產革命運動中的地方菁英──返鄉知識份子黨員角色的再探討〉，陳慈玉編，《地方菁英與臺灣農民運動》，頁231-258，臺北：中央研究院臺灣史研究所。
• 陳耀煌，2006，〈抗戰前冀南地區的硝鹽問題──兼評Ralph Thaxton, Salt of the Earth一書〉，彭明輝、唐啟華編，《東亞視角下的近代中國》，頁419-466，臺北：政大歷史系。
• 陳耀煌，2004，〈圍剿與反圍剿：論反羅明路線鬥爭的源起，1931-1933〉，胡春惠、薛化元編，《近代中國社會轉型與變遷》，頁425-446，臺北；香港：國立政治大學歷史學系；珠海學院。
• 陳耀煌，2003，〈路線之爭？──中共湖北省委事件〉，胡春惠、吳景平編，《現代化與國際化進程中的中國社會變遷》，頁651-671，上海；香港：復旦大學歷史系；珠海大學亞洲研究中心。

學術會議(研討會)論文

• 陳耀煌，2022，〈1950年代中国農村の副業と市場〉，發表於1950年代，中国共産党権力の社会への浸透とその矛盾に関する共同研究，マイクロソフトチームズ「山本科研」：筑波大学，2022-03-21。
• 陳耀煌，2016，〈伝統から現代へ：20世紀中国基層農村リーダーの性格の変化〉，發表於アジア政経学会秋季大会，北九州：アジア政経学会，2016-11-19。
• 陳耀煌，2015，〈傳統與現代：中共土地改革的歷史意義再思考〉，發表於台社論壇：重探台灣戰後農村土地改革，中央研究院人社中心第一會議室：中央研究院人文社會科學研究中心東亞經貿發展計畫，2015-05-30。
• 陳耀煌，2015，〈談革命——口述歷史裡的中國農村變革〉，發表於「從口述歷史尋找新議題」工作坊，中央研究院近代史研究所檔案館中型會議室：中央研究院近代史研究所，2015-03-20 ~ 2015-03-21。
• 陳耀煌著，白左暉、河野峰生譯，2013，〈動員のパターン―北京市郊區農村民衆運動の分析（1949～1965）〉，發表於東アジア史の比較・連関からみた中華人民共和国成立初期の国家・基層社会の構造的変動，筑波大学東京キャンパス：中国基層社会史研究会，2013-07-07。
• 陳耀煌，2012，〈在共產中國發現歷史：西方毛澤東時代中共農村革命〉，發表於回首民國百年，中央研究院近代史研究所：中央研究院近代史研究所，2012-01-11 ~ 2012-01-13。

學位論文

• 陳耀煌，2005，〈內生抑外塑：河北地區的共產革命，1921-1949〉，共328頁，歷史學系，政治大學。

他類論文

• 陳耀煌，2013，〈集體恐懼──中共的思想改造〉，《歷史知識──行家開講中西大事》，頁13-16。
• 陳耀煌，2011，〈慘勝與慘敗的戰爭：國共內戰〉，《百年風華》，頁96-97。

學術書評

• 陳耀煌，2021，〈石川禎浩著，袁廣泉譯，《「紅星」是怎樣升起的：毛澤東早期形象研究》〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，113, 131-137。
• 陳耀煌，2014，〈國家的內卷化：趙泉民，《政府‧合作社‧鄉村社會─國民政府農村合作運動研究》魏文享，《國民黨、農民與農會：近代中國農會組織研究(1924-1949)》王奇生，《革命與反革命：社會文化視野下的民國政治》〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第83期。
• 陳耀煌，2012，〈Ezra F. Vogel, Deng Xiaoping and the Transformation of China. Maurice Meisner, The Deng Xiaoping Era: An Inquiry into the Fate of Chinese Socialism, 1978-1994.〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第77期，頁163-169。
• 陳耀煌，2011，〈Mary G. Mazur, Wu Han, Historian: Son of China’s Times 〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第74期，頁179-185。
• 陳耀煌，2009，〈Kevin J. O’Brien, ed., Popular Protest in China〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第66期，225-230。
• 陳耀煌，2007，〈高地的革命：中國的井岡山根據地〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第58輯，頁201-207。
• 陳耀煌，2006，〈中國在戰爭與革命之中：Peter Zarrow, China in War and Revolution, 1895-1949〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第54期，247-253。
• 陳耀煌，2003，〈Peasants Without the Party: Grass-roots Movements in Twentieth-Century China. By Lucien Bianco〉，《中央研究院近代史研究所集刊》，第42期，179-185。

資料彙編(含口述歷史)

• 黃克武、游鑑明、潘光哲、林志宏、陳耀煌、沈懷玉訪問，周維朋、林東璟、李品寬、溫楨文、柯小菁、林易澄紀錄，2012，《蔣中正總統侍從人員訪問紀錄，下篇》，共552頁，臺北：中央研究院近代史研究所。
• 陳耀煌、唐立宗、林丁國，2004，《臺灣地區館藏大陸期刊明清史研究彙編(1949-1993)》，共399頁，臺北：政治大學歷史系。