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助研究員
社會史、性別史、東南亞華人史
副研究員
科技史、環境史、十九世紀通商口岸、GIS與歷史研究
研究員
蘇聯史、黨國體制比較、中蘇文化關係
近代中國族群政治史；中共史
明清思想文化史
研究員兼副所長
明清社會經濟史、明清文化史、中國城市史
中國近現代經濟史，經濟思想史
地方政治制度史、社會生活史
中國「現代政治」史、國民政府史、國共政治比較研究、政治史方法論、青年政治
副研究員兼胡適紀念館主任
近代中國思想文化史、學術史
中國近代社會經濟史、抗戰史
近代中國社會文化史、法制史、教育史
明清及近代思想史、制度史
中國語言學及語言知識史；中國學術及教育史；清帝國與世界史
特聘研究員
中國宗教社會史，台灣宗教社會史，中國道教史
中國醫療史、東亞科學史
研究員兼檔案館主任
通商口岸文化、運動與殖民、近代中國企業史
婦女史、城市文化史、企業史
冷戰史、美國對外政策、東亞近代史
近代中國思想文化史、概念史與詞彙史、當代歐美史學理論
研究員兼資訊室主任
科學史、20世紀中國、身體史、科技與社會
近代中國文化史與政治史，維吾爾文學與歷史
近代中日關係史研究、近代日本政治思想史研究、近代日本外交史研究
中國近代思想史、文化史
研究員兼所長
傳統醫療與公共衛生史（近代中國與台灣）、科技史與身體史、科技與社會研究
晚清史
清史
視覺文化史、晚清中日交流、清宮研究、中歐圖像交流
知識史、科學史
死亡、犯罪與暴力
近代中國軍事史、民國政治史、蔣中正研究